Buenas,

No, no, cada cual debe usar sus normas. Aunque cumplan con la misma función, en Joomla 1.5.x se deben usar las que se incluyan en su archivo htaccess.txt y en Joomla 1.0.x las que se incluyan en su archivo htaccess.txt
Si no recuerdo mal, es apartir de Joomla 1.0.10 que se empiezan a incluir dentro del paquete esas líneas de protección (en versiones anteriores se tenian que "copiar y pegar")
Lo que recuerda este hilo es que se deberían habilitar las normas anti-exploit desde archivos .htaccess, o bien renombrando el archivo "htaccess.txt a .htaccess" (el que se incluya junto al paquete de Joomla! que hubiéramos instalado), o, "copiando y pegando el bloque en un archivo .htaccess"
El que estén dentro de un archivo de extensión ".txt" no hace efecto alguno, y, para habilitarlas desde un archivo .htaccess (no olvidar el punto a la izquierda) quien te sirva el hospedaje debe permitirte usarlos (o tampoco hacen efecto alguno)
Para más infomación, podeis revisar este hilo
sobre el .htaccessEspero te pueda servir.